以贫苦农民为成员的游击队建立以后，引起了反动地主和富农的仇恨，他们一面向外转移财产，一面等待时机，企图发动叛乱。1938年的一个秋夜，地主反动武装包围了游击队的队部，抓住了游击队的正副队长和几名游击队员，在对他们进行残酷的殴打之后，将队长孙吉祥和副队长用铁丝穿了锁骨送给了平谷县城的日军。
几天后，单得贵副司令员派杨营长带领部队从北土门、东长峪方向向鱼子山进军，一举消灭了地主反动武装，收缴了全部武器，并将几名地主头目交给抗日政府处置，叛乱被平息了。
为了更有效地打击敌人，八路军与民兵、游击队相互配合，村与村之间也形成了庞大的联络网，山顶日夜有哨兵巡逻，有力的打击了日本侵略者。
1940年的正月十五，当村民正在准备元宵佳节的时候，镇罗营的日军突然闯入了鱼子山村，抢夺了大批粮食、衣物、牲畜，并要求我村民作“向导”，搜索八路军。在敌人行至大峡谷将军石时，早已埋伏在此的我八路军和民兵一起射击，当场打死日军1人，俘虏伪军4人，并缴获一批武器弹药，被敌人抢走的粮食、衣物、牲畜等也被夺回。
1941年11月，南独乐河和峨眉山据点的日伪军趁着黎明向鱼子山村发动了进攻，一进村即遭到我游击队和民兵的猛烈打击，敌人在丢下数十具尸体后狼狈逃回，此役共打死打伤日伪军50余名，活捉伪军5人，缴获大批军用物资。
抗日形势的日益发展，使敌人既感到恐慌，又对鱼子山恨之入骨，多次调集日伪军对根据地进行扫荡和围剿，妄图用杀光、烧光、抢光的“三光政策”来扑灭鱼子山的抗日火焰。1941年11月22日，200多名日伪军包围了鱼子山村，在山梁架起机枪。凌晨，群众往村外突围时，遭到机枪的疯狂扫射，当场有60多人被残杀。12月11日，天刚亮，日军又包围了鱼子山，将来不及撤离的30多名群众抓住，其中4人扔进火里活活烧死。制造了惨绝人寰的“鱼子山惨案”。
1942年农历的腊月二十九，峨眉山的日伪军再次包围了鱼子山，将住在西山坡窝棚里的李家7口，上至70多岁的老人，下到刚满周岁的婴儿全部刺死。并且逼被抓住的村民说出游击队和兵工厂的下落，村民们不说，日寇就把人拉出来用刀砍，可怜这些人死后都无人收埋，竟为野狗吞噬！从1933年5月日军侵入平谷境开始，至1945年9月13日日伪军逃往三河的12年期间里，鱼子山村共有180多人被杀害，2000多间房屋被烧毁，鱼子山成为一片焦土。
但是，在多年的抗日斗争中，鱼子山人民在党的领导下，始终以顽强的精神，坚持斗争，从来没有向日本侵略者屈服过，素有“铜南山、铁北寨、打不垮的鱼子山”之称。在解放后，上级党组织称鱼子山村为“打不垮，拖不乱”的铁鱼子山村。
