二，勤王不及，反扑大都。
大都的陷落开始了扩廓护卫元裔的后半生。至正28年10月，元惠宗封扩廓为齐王。当时的形势是，明朝发布 “驱除胡虏，恢复中华，立纲陈纪，救济斯民” 的北伐檄文，明兵根据明太祖的战略先占领了山东，益都守将魏赛因不花投降；明兵诉河上河南，扩廓的弟弟脱因帖木儿在洛水北岸被击败逃走，梁王阿鲁台（察罕的爸爸，扩廓的干爷爷）投降，明兵捣潼关，至华州，李思齐等闻风远遁。于是明兵从德州、长芦一线直捣大都，惠宗北狩，明兵占领大都。以孙兴祖守大都，徐达、常遇春等人攻打冀中一带，作为进攻山西的跳板。而长城以南的元兵则只有扩廓拥兵山西了。明军还是比较惧怕扩廓的，攻打大都的战略部署基本上是避开扩廓。但大都陷落，明军不得不要面对这个劲敌了，可惜初战虽是扩廓的大胜，但由于惠宗的瞎指挥，致使扩廓全军覆灭。
明军占领大都后，常遇春的主力即南下保定、中山、真定做为取山西的北路军。徐达的部队则在漳德一带，作为南路军。作为徐达前锋的汤和部，自怀庆取泽州，形成孤军冒进的态势。扩廓迅派军南击汤和，在韩店大战，明军惨败。明将汤和自此败后被调到西部战场，也算太祖的小小惩罚吧。
但韩店的胜利却被惠宗的瞎指挥破坏了。实际上，惠宗之逃离大都实在有些仓促，其实以大都城之坚韧是完全可以守城待援的。惠宗逃到了开平，才发现让出大都城实在太可惜了，于是命令扩廓收复大都。扩廓于是集合主力，北出雁门，经保安、居庸关，向北京攻击前进。
而此愚蠢的行动迅速被老谋深算的徐达等人发现了弱点。徐达等人认为北平有孙都督据守，且有坚城，不足为虑。扩廓倾巢而出，太原空虚，明军主力均在太行东南部真定、漳德一带，离太原很近。于是采用批亢捣虚的战术直捣太原。扩廓慌忙回救太原，其部将豁鼻马约降。当时明军骑兵先到，而步兵未完成集结。常遇春向徐达建议:“我骑兵虽集，步卒未至，骤战必多杀伤，夜劫之可得志。”（《明史常遇春传》）徐达采用了常遇春的建议，选精骑夜袭扩廓。“扩廓方燃烛治兵书，仓促不知所出，跣一足，乘孱马，以十八骑走大同。……（明军）遂克太原。遇春追扩廓至沂州而还。”（《明史常遇春传》）
明军在平定山西后，即平定了陕西。然后用兵东部，保卫北平的侧翼。而北元则东有纳哈出，西有王保保，战争逐渐分为两个战场。
三，拥兵塞外，保卫元裔。
洪武元年八月明军攻陷大都后，于第二年六月进行了第一次北伐。由常遇春帅步骑九万出北平，经过会州、锦州、全宁（今内蒙古翁牛特旗地方）、攻下了开平。元惠宗逃到开平以北的应昌，即现内蒙古达来淖尔湖（Dal Nor）的西南岸。一代名将常遇春，在完成这次任务后，暴疾卒于回师途中，年仅40。代替常应付东面战场的是李文忠。
扩廓此时在西方，可能是作为对明军第一次北伐的牵制，扩廓带军包围了明将张温据守的兰州。明军派出的援军被扩廓全歼，援军首领于光也被杀死。
在这种情况下，明军立即于洪武三年一月三日开始了第二次北伐。在制定进攻方略时，包括名将徐达在内的所有将领都异口同声地建议大军直扑应昌，逼扩廓从兰州撤兵。可见徐达等人都不太情愿直接与扩廓交锋。但太祖力排众意，命令明军兵分两路。西路由大将军徐达自潼关经西安救兰州，寻机歼灭扩廓；东路由左副将军李文忠出居庸关，直捣应昌。这是使敌人“彼此自救，不暇应援”的方略。（《明鉴易知录，卷一》）
战事进行到四月，东西两线都发生了惊天动地的大事变。东线是北元惠宗于4月28日突然逝世，元惠宗孛儿只斤氏，讳妥欢帖睦尔，蒙古文献称为乌哈图汗。在位37年，年51岁。在位期间荒淫无度，任用奸党，戕害忠良，对南方的反叛也姑息任之。但他心灵手巧，曾制造宫漏，奇妙无比，又会观天象。可惜世祖打下的大好江山毁在
手里。他的儿子爱猷识理达腊（Ayu Sridara,即元昭宗，死后明人称太子毕里秃，蒙古文献中的比力克图汗Biliktu Khan）即位，改元宣光。（宣光元年为第二年即洪武四年，本年仍为至正30年）在此国丧前后，李文忠已经先后夺取了应昌外围的重要据点兴和、察罕淖尔等地,五月13日，李文忠在离应昌百余里的地方从一俘虏的口中得知北元惠宗死讯，督师急弛两日至应昌，“明日克之，获元主嫡孙买的里八剌并后妃宫人……唯太子爱猷识理达腊与数十骑遁去。文忠亲帅精骑追之，至北庆州，不及而还。”（《明实录》）。东方战场以北元的惨败告终，《皇明资治通纪》在评论第二次北伐东方战场时记载:“大军所至，朔廷遂空。”
西部的扩廓也遭到了惨败，这就是明初的沈儿峪之战。扩廓在听说徐达援兰州的消息后，急忙固守兰州东面的定西准备迎击。四月，徐达在沈儿峪全歼扩廓军。“达出安定，驻沈儿峪口，与王保保隔深沟而垒，一日，达整众出战，大败王保保兵于川北乱冢间,……保保与其妻子数人从古城北遁去，至黄河，得流木以度，遂出宁夏奔和林。”（《明鉴易知录，卷一》）西部的战事也结束了。
