努尔哈赤原表示，自己百年之后，要将深受宠爱的大妃，还有年幼的子孙们托付给代善。从而，一度使代善的权势极为显赫。倒是准太子代善，他可能并不真正了解其父的真实想法与性情，结果是努尔哈赤痛恨自己还活着时就开始眉来眼去的大妃和代善。不久，就削弱了代善的权利。代善失去了父亲的欢心，被迅速灰头土脸边缘化，也害了大妃。
或许，努尔哈赤对阿巴亥的情意并未泯灭，休弃不到一年又将她接回，继续做大妃。《太祖武皇帝实录》记载：由于大妃有机变且好嫉妒，使努尔哈赤觉得不快，留下她恐怕身后会祸乱国家，于是预先给诸王交代遗言说：“等我死时，必须命令她为我殉葬。”后来，努尔哈赤死后的第二天一大早，诸王便来向她转达努尔哈赤的命令，大妃支吾不从，诸王寸步不让地坚持，大妃阿巴亥自缢而死。也有史书认为，她是被用弓弦勒死的。
母亲殉葬时，多尔衮虚岁十五岁。按照女真人的习俗，已经成年。并与多铎最受晚年努尔哈赤的喜爱，但他当时没有尺寸武功，在皇太极跟随努尔哈赤驰骋疆场时，多尔衮还没有出生，他没有可能被推举成继位的汗王。
