王皇后徒有皇后尊号，被冷落一边，好在王政君生性柔顺，不是争风吃醋的女人，汉元帝对皇后家的家庭，照例给予恩典，王氏家庭封王者，多至十人，为西汉末年外戚擅权埋下了祸根。但是她的儿子、皇太子刘骜越来越让元帝不满。刘骜曾好读经书，恭谨有冖。有一次，元帝召他，他闻诏忙前去。但刘骜不敢横穿皇帝专用的驰道，而是绕了一个大弯。元帝见太子来迟，责怪太子，刘骜说明了原因，元帝很高兴，但好景不长，刘骜对经书渐渐厌烦了，整日游手好闲喜欢喝酒、游玩。元帝多次训斥，但太子屡教不改，于是元帝打算废黜刘骜，另立傅妃之子刘康。
公元前33年（汉元帝竟宁元年）。元帝病重，傅昭仪、刘康在侧侍奉，皇后，太子被拒之门外，一天，元帝向其近臣透露他要废黜，另立刘康为继承人的心愿。王皇后、太子听后，惶恐不知所措。这时，元帝宠臣侍中史丹闯进元帝寝宫，顿首涕泣而言；“皇太子名闻天下，臣民归心。今臣听陛下有废立之意。若是这样，请陛下先赐我死吧！”元帝见状，长叹一声，说：“没有此事。皇后谨慎，先帝又疼爱太子，寡人岂敢违先帝之意？”就这样刘骜保全了皇太子的名字，王政君也保全了皇后的凤冠。
公元前33年（汉元帝竟宁元年）五月，元帝死于未央宫，终年四十三岁。刘鳌继位为汉成帝，尊王氏为皇太后，移居长乐宫。耽于声色的成帝任命舅王凤为大司马大将军领尚书事，掌理朝政。成帝自己整日游山玩水，斗鸡走狗，朝政大权实际掌握在皇太后和她哥哥王凤手中，堂堂天子也得看他们眼色行事。
成帝身体多病，即位多年无子。定陶王刘康来朝，成帝留他在京师伴驾，有以刘康为帝位继承人之意。绥和二看（前7），成帝驾崩，定陶王刘康的儿子刘欣即皇帝位，是为哀帝。哀帝尊皇太后王政君为太皇太后。哀帝即位后，他的祖母傅昭仪、母亲丁姬两家成了新的权贵，与王氏外戚在权益分配上发生冲突，太皇太后命王莽辞职以缓和矛盾，王莽极不情愿的上书辞官。
