紧急搜救
接到消息后，美海军当局下令让深潜器“曲斯特”号参加搜索。6月27日，“曲斯特”第3次潜到距海面2560米的海底处搜索时，收集到大量的纸片和碎物。在杂物中搜救人员发现有一只黄颜色的橡胶套鞋，这种套鞋只有在核潜艇的反应堆隔舱工作时才会使用。由于这种套鞋平时锁在一个箱子里，因而决不会自动跑到海里来。搜救人员还发现，用漏模印刷在套鞋上的号码是SSN5……终于使这最后一批证物被确认为是“长尾鲨”的遗物。
1964年从“北斗六”号上拍摄的“长尾鲨”号指挥舱
就这样，服役不满两年的“长尾鲨”号核潜艇连同129名乘员一起横卧在2560米的海底。这是历史上发生的第一次核潜艇沉没事故。
亡羊补牢
1963年6月，美国海军部长弗·考斯公开了调查委员会有茉“长尾鲨”失事的调查结论：
“机舱内突然地大量进水，被认为是核潜艇‘长尾鲨’号于1963年4月10日沉没在科德角以东200海里处的最为可能的原因。”
“海军深信最可能的原因是‘长尾鲨’的海水系统的某个局部出了毛病，且很可能在机舱范围。潜艇周围的海水在巨大压力作用下涌入舱室时会造成猛烈的水雾。进入舱室的海水使输电网络失效且导致潜艇失去动力。‘长尾鲨’航速下降之后开始下沉，片刻便超越它的临界深度，最后停在2560米的海底上。”
“长尾鲨”号沉没之后，美国海军采取了一系列善后措施：
——对已服役和已下水之各艇(“长尾鲨”号失事时，其同级艇2艘已服役，7艘已下水)之强度进行仔细的检查。
——对按原计划已经制成的所有耐压部分，均加大其安全系数，减少试验试航深度，降低试验压力，对各型潜艇的潜航深度作’了限制。换句话说，如设定压坏深度为396米、安全系数取1.5时，则试验深度大致为270米。
——由于以上处置将显著地限制本级艇的效能，为力求维持住史无前例的396米的试验潜航这一记录，决定对“三叶尾鱼”号、“小鲨鱼”号等实施特别的改型工程。
——改进应急主压载水舱吹除系统。原来的吹除系统继续用作正常情况下的吹除而予以保留，附加一段应急旁路，以便在紧急情况下加大空气的供给。在美国国会关于该艇沉没作证时，提到主压载水舱吹除系统的设计概念是个薄弱环节，从而限制了潜艇从进水事故中恢复生命力的能力。根据一是整个系统的设计概念是从第二次世界大战期间的潜艇抄来的，吹除速度没有增加到足以应付大深度时的能力，从而发生的高速进水导致了事故；二是管路长度的计算和控制装置的复杂性使得主压载水舱的吹除系统成了薄弱环节。
1963年从小型深潜艇“里雅斯特”号水下拍摄的“长尾鲨”号残骸
——1964年3月，美在新伦敦潜艇基地新设了潜艇安全计划中心，其任务是：对正在服役、建造和设计中的全部潜艇从设计蓝图到实艇的全部装置和结构的强度进行验核，对已有的舰员编制和部署进行调研和修订，对包括核武器、核动力装置在内的潜艇总体安全问题经常予以密切注意，发现问题可向海军作战部长、舰队司令或潜艇纵队司令部提出建议。
